Fédération du Commerce

Dans l'intention de maîtriser la Fédération de Commerce autant que pour trouver de nouveaux fonds, la République décida la taxation des routes commerciales éloignées. Scandalisée, la Fédération du Commerce n'hésita pas à organiser un blocus avec ses énormes vaisseaux de combat autour de la pacifique planète de Naboo pour protester. Cette action audacieuse choqua énormément le Sénat, qui contesta de plus en plus la politique du Chancelier Finis Valorum. Celui-ci envoya secrètement deux ambassadeurs Jedi à Naboo pour parlementer avec les Neimodiens, mais ceux-ci tentèrent de les tuer. Ce que tout le monde ignorait c'est qu'en fait la Fédération de Commerce n'était qu'un pion entre les mains d'un Seigneur Sith, Darth Sidious. Il manipula le Sénat avec soin, bloquant l'institution dans des procédures pendant que la Fédération faisait pression sur la reine Amidala de Naboo pour signer un traité acceptant son occupation de la planète. C'était compter sans le courage et l'obstination de la reine qui refusa de signer le moindre traité. Les Neimodiens, poussés par Darth Sidious, lancèrent alors une invasion de Naboo avec des légions de machines et de Droides de Combat qui écrasèrent rapidement les Naboo, mais la reine échappa et parvint au Sénat de Coruscant pour décrire la situation. Comprenant que le Sénat ne ferait rien de concret, elle repartit pour Naboo après que Finis Valorum ait été remplacé comme Chancelier par Palpatine, et réussit à repousser les envahisseurs neimodiens avec l'aide de la Grande Armée des Gungans. Rune Haako et Nute Gunray furent arrêtés, mais ceux-ci gardèrent secrète l'existence de Darth Sidious.



Malgré le scandale de Naboo et sa défaite coûteuse, la Fédération de Commerce continua à opérer, devenant même encore plus puissante. Elle remit sur pied en cachette une armée de droides encore plus forte et perfectionnée. Nute Gunray réussit même à garder son titre de Vice-roi après une série de procès. Nute Gunray s'allia au comte Dooku, un ancien Jedi qui avait pris la tête du mouvement séparatiste qui prenait de l'ampleur partout à travers la galaxie. Sa fidélité au capitalisme et au libéralisme rallia les plus grandes organisations commerciales de la galaxie. Nute Gunray avait une seule exigence: la mort de Padmé Amidala, redevenue sénateur de Naboo. La jeune sénatrice devint la cible de plusieurs tentatives d'assassinat, auxquelles elle échappa à chaque fois. Malgré cela, Gunray engagea l'armée de droides de la Fédération du Commerce (Droides de Combat classiques, Droidekas et Superdroides de Combat) aux côtés des Séparatistes à la bataille de Geonosis contre l'armée de clones de la République.